決済方法はどうなりますか?

月間プランは、設定 -> 決済管理 -> プラン購入にて決済できます。
年間プランは、税金計算書を発行します。

1年以上の長期の決済をすると追加割引などの特典がありますか?

月間プランに対して約20%の割引率を適用します。

決済しましたが件数がチャージされていません。

決済する時、既存の件数が残っている場合には残っている件数がすべて消費されてからチャージされます。満了日も決済日ではなくチャージされた時点から再適用されます。